Клиенту был выставлен счёт

Если в договоре не определено, что считать датой платежа, то такой датой следует считать не дату направления платежного поручения в банк, а дату, в которую денежные средства поступили из банка плательщика на счет банка получателя. Такая позиция основана на ст. ст. 316, 403 ГК и п. 3 постановления Пленума ВАС от 19.04.99 № 5.

Следовательно, если покупатель выполнил платеж с опозданием, то продавец вправе либо отказаться от передачи товара (но в этом случае он должен вернуть плательщику полученные от него деньги) , либо принять платеж и передать покупателю товар. В последнем случае продавец может не выставлять новый счет, так как действия продавца по передаче товара будут являться конклюдентными, т. е. однозначно выражающими волю продавца исполнить договор. В силу ст. 158 ГК сделка может быть заключена путем совершения определенных действий, выражающих намерение стороны вступить в правоотношение.

Оплата произведена вовремя, никаких претензий не должно быть.

А в чем проблема? СЧет бывает действителен определенное время как гарантия обозначенной в нем цены, а за пределами этого срока продавец эту цену уже не гарантирует. Оплачивать товар можно и без счета - это не противоречит правилам безналичных расчетов. Сроком платежа (если в договоре не указано иное) является направление в банк платежного документа при наличии достаточности средств на счете плательщика.

не нужно ничего переделывать, придирок не будет, можно проигнорировать.

нет. не бздякай! если нет договора, банк может запросить счет. ю ну представишь им этот счет.

ГК РФ Статья 194. Порядок совершения действий в последний день срока

1. Если срок установлен для совершения какого-либо действия, оно может быть выполнено до двадцати четырех часов последнего дня срока.
Однако если это действие должно быть совершено в организации, то срок истекает в тот час, когда в этой организации по установленным правилам прекращаются соответствующие операции.
2. Письменные заявления и извещения, сданные в организацию связи до двадцати четырех часов последнего дня срока, считаются сделанными в срок.

Бухгалтерия совершила свои действия (оплатила счет) вовремя за час (полчаса, два часа) до окончания срока действия счета.

всё уже сделано, придирок быть не должно, по документам всё правильно

нужно