Когда камера разряжается, снятое до этого видео пропадает.

Нет

... исправить программно это нельзя .
придётся следить за аккумуляторами, обеспечить бесперебойное питание, или вовремя делать паузу в съёмках

Чтобы потери были минимальны, поставить в настройках цикличность по времени или весу файла, чтобы камера писала файлы, допустим по 500-700мб, сохраняла и писала следующие 500-700мб.
p.s. Если вообще гаджет на такое способен.

Увы, Canon не позаботился о сохранности отснятого Вами материала, как сделали это другие производители, которые при севшем аккумуляторе завершают запись принудительно.

> Эти видео потеряны?

Как правило, нет, место аллоцировано и данные записаны. Если успела обновиться FAT, то даже известно, куда. И точно данные не потеряны, если сразу вынуть карту памяти и не записывать на неё ничего больше.

> Можно как это исправить?

Думаю, что нет. Только следить за уровнем заряда и проактивно принимать меры или использовать стационарный блок питания, если есть возможность. Я не знаю, что на этот случай предусмотрено у Canon, у Sony на этот счёт есть поделка, которая одной стороной включается в сеть, а другой в специальный разъём на фотоаппарате. С другой стороны, Sony перед аварийным выключением успевает остановить запись и привести метаданные файла в порядок, чтобы результат был как при штатной остановке записи.

У кэнона, когда остается 10% аккума, одна полоска заряда начинает мигать, чтобы пользователь был в курсе о скором отключении камеры. Зачем ждать, пока отключится камера, если у вас есть ещё аккумулятор?
Если файл весит 0 байт, значит, в нем нет никакой информации. Запись не завершилась, видео не сохранилось. Откуда вы собрались брать отсутствующую инфомацию?

не стоит доводить до 0% заряда, лучше заранее сохранить все.
всегда на съемке следите за уровнем заряда.

Купи Адаптер питания от повербанка, или электра-сети, и не страдай
https://aliexpress.ru/item/1005002022123422.html?algo_expid=313edaa9-f607-41ea-b143-a62bfef43918-5&algo_pvid=313edaa9-f607-41ea-b143-a62bfef43918&sku_id=12000018442838072&spm=a2g0o.search.0.0.763c8541uICgYC