Подскажите, пожалуйста, сколько мне нужно будет заплатить налог с продажи квартиры?

В соответствии с подпунктом 1 пункта 1 статьи 220 Налогового кодекса Российской Федерации при определении размера налоговой базы, облагаемой по ставке 13 процентов, Вы имеет право на получение имущественного налогового вычета в сумме, полученной Вами в налоговом периоде от продажи жилых домов, квартир, комнат, включая приватизированные жилые помещения, дач, садовых домиков или земельных участков и долей в указанном имуществе, находившихся в собственности менее трех лет, но не превышающих в целом 1 000 000 рублей.
Вместо использования права на получение имущественного налогового вычета, Вы вправе уменьшить сумму своих облагаемых налогом доходов на сумму фактически произведенных и документально подтвержденных расходов, связанных с получением этих доходов.
Таким образом, при продаже квартиры, находившейся в собственности менее 3-х лет, сумма дохода, превышающая 1 000 000 рублей или размер документально подтвержденных расходов, связанных с получением этих доходов, подлежит налогообложению по ставке 13 процентов.
Согласно подпункту 2 пункта 1 статьи 228 Кодекса физические лица, получившие доходы от продажи имущества, принадлежащего этим лицам на праве собственности, обязаны самостоятельно исчислить суммы налога,
подлежащие уплате в бюджет, и представить в налоговый орган по месту жительства налоговую декларацию по налогу на доходы физических лиц не позднее 30 апреля года, следующего за истекшим налоговым периодом.
Таким образом, в срок не позднее 30 апреля 2013 года Вы обязаны были представить налоговую декларацию формы 3-НДФЛ за 2012 год и отразить доход, полученный от продажи квартиры.
Согласно положениям подпункта 2 пункта 1 статьи 220 Кодекса Вы также имеет право на однократное получение имущественного налогового вычета в сумме, израсходованной на приобретение на территории Российской Федерации жилого дома, квартиры, но не более 2 млн. рублей.
Указанный имущественный налоговый вычет предоставляется по доходам, подлежащим обложению налогом на доходы физических лиц по ставке 13 процентов, по окончании налогового периода при подаче им налоговой декларации по форме 3-НДФЛ в налоговый орган по месту жительства и документов, подтверждающих право налогоплательщика на получение данного налогового вычета.
Имущественный налоговый вычет по расходам на приобретение квартиры предоставляется на основании договора купли-продажи, свидетельства о государственной регистрации права собственности на квартиру и иных документов, перечисленных в подпункте 2 пункта 1 статьи 220 Кодекса.
Если продажа квартиры и получение свидетельства о государственной регистрации приобретенной Вами квартиры имели место в одном налоговом периоде, Вы вправе в налоговой декларации по налогу на доходы физических лиц в отношении дохода от продажи квартиры одновременно заявить как имущественный налоговый вычет, предусмотренный подпунктом 1 пункта 1 статьи 220 Кодекса, в размере 1 000 000 рублей, так и имущественный налоговый вычет по расходам на приобретение доли в квартире при условии, что ранее не использовали свое право на получение имущественного налогового вычета, предусмотренного подпунктом 2 пункта 1 статьи 220 Кодекса.
Если в налоговом периоде имущественный налоговый вычет по расходам на приобретение доли квартиры не может быть использован полностью, его остаток может быть перенесен на последующие налоговые периоды до полного его использования.
В случае, если в налоговом периоде у налогоплательщика отсутствуют доходы, облагаемые налогом на доходы физических лиц по ставке 13 процентов, воспользоваться имущественным налоговым вычетом, предусмотренным подпунктом 2 пункта 1 статьи 220 Кодекса, в этом налоговом периоде он не вправе.

...с 900 тысяч 13%

А вот сначала ответьте на вопрос-на основании какой сделки у Вас появилась квартира, которую продаете-купили или безвозмездно .Начнем от этого считать

Продажа квартиры идет с вычетом в миллион.
И покупка квартиры дает льготу на миллион.
Вот только не знаю, суммируются льготы в данном случае или нет.

я тоже думаю. что 13 %- налог с продажи

не суммируются, это разные виды вычетов.