Продажа магазина физическому лицу

НИ хрена в этом НЕ ПОНИМАЮ, НО .. если порассуждать на эту тему, то ...

как площадь, квартира или помещение, физическое лицо не может заниматся торговой деятельностью.

на кого зарегистрирована коммерческая недвижимость?

Ну если "фирма" состоит не только из этого магазина, а ведет еще другую деятельность, то продажа магазина зависит от того, что конкретно вы продаете , и что покупает это физ.лицо и для каких целей ?
Продаете магазин как бизнес в целом, или продате имущество по отдельности ?
Если это физ.лицо собралось покупать у вас магазин как бизнес, ну так и продавайте его как бизнес. "Фирма" -это что юр.лицо ? Проводите реорганизацию, путем выделения юр.лица -ООО. Переоформляете все договора на это новое ООО -право собственности на недвигу, договора аренды, коммуналки, с поставщиками, охраны, программного обслуживания, регистрируете расчетный в банке на новое ООО, переоформляете на него эквайринг, ккт ставите на учет ФНС и тд, переводите в него сотрудников магазина, делаете разделительный баланс -переводите все остатки товара в магазине на новое ООО, торг.оборудование, программное обеспечение. Ставите на учет в фнс ккт, регистрируетесь в честном знаке и тд . .по полной программе чтобы новое юр.лицо могло бы продолжать работу прежнем режиме и с прежними сотрудниками, не заключая снова каких-то ранее существовавших договоров. А затем продаете 100 % долю в этом новом ООО -покупателю, физ.лицу.
Ну или вариант -два, при согласии покупателя, продаете ему -по отдельности, недвижимость -помещение этого магазина, торговое оборудование, товарные остатки по договору поставки. А далее сей покупатель сам занимается регистрацией своего бизнеса . Возможно покупатель такого имущества, прежде чем его покупать, зарегистрирует на себя ИП на УСН доход-расход,
а уж потом будет у вас все покупать, иначе он не сможет купленное включить в расходы при УСН доход-расход.