Что некоторых не устраивает в религиозных взглядах Льва Николаевича Толстого?

Попов в основном не устраивает. Особенно его отрицание Павла, троичность бога, церковные таинства да и христианство в целом после Константина.
А так, своеобразное и по-своему прекрасное учение. Очень интересный взгляд на христианство, как по мне, намного ближе к оригинальному учению Христа, чем у ортодоксов.

Лев Толстой не выдумал ничего нового, его религиозные взгляды до него пропагандировали протестанты-отрицание Христа Богом, отрицание церкви, непротивление злу насилием

Он Евангелие на свой лад хотел переписать.

вел дневник всего 63 года..
а мог бы и дольше : лет хотя бы 80

Если бы Л. Н. Толстой вёл дневник без фантазий-то это компромат.

Обычно он не нравится безбожникам.

Я не сильно знаком с Толстовским религиозным учением.
Но непротивление злу, это как раз я одобряю, и это согласуется с Библейским учением.

Немного тебе осталось до понятия истины - подставь другую щёку и оьдай последнюю рубашку. Жизнь временна, неужели нельзя потерпеть до конца?

Большинство не устраивает во взглядах Толстого то, что они с ними незнакомы...

"не сопротивление злу" - вы, видимо, плохо читали. У него нет такого.

Потому что:
«Я перед смертью стал смелее отступать от исключительности христианства» (12,с. 225). Врач В. В. Люстрицкий вспоминал, как 19 июня 1910 г. «Лев Николаевич сказал, что он одинаково относится к Евангелию, БРАМАНИЗМУ, буддизму и конфуцианству» (14,с. 441). Более того, 22 июня 1910 г. он признался Ф. А. Страхову: «Не хочется мне этого говорить, но уж скажу: как раньше я любил Евангелие, так теперь я его разлюбил» (9,с. 293). «Учение Христа является для меня только одним из прекрасных религиозных учений, — писал Толстой, — которые мы унаследовали от древних египтян, евреев, ИНДУСОВ, китайцев, греков. Два великих принципа Иисуса: любовь к Богу и любовь к ближнему проповедовались всеми мудрецами мира: КРИШНОЙ, Буддой, Лао Цзы, Конфуцием, Сократом… Истина нравственная и религиозная всегда и везде одна и та же. Я не чувствую никакого предпочтения к христианству." (Л. Н. Толстой)

Лев Николаевич был неплохим писателем. (Мне у него нравится повесть"Воскресение"."Севастопольские рассказы" тоже можно почитать.) Но в то же время он так же был и мракобесом: веровал в еврейского Б-га, в сына еврейского Б-га, и в то, что труп сына еврейского Б-га ожил.
Веровал в загробную жизнь.

Из книги Л. Н. Толстого "Обращение к духовенству" 1902 г.:
«Если бы вся эта история Ветхого и Нового завета преподавалась как сказка, то и тогда едва ли какой – либо воспитатель решился бы рассказать ее детям или взрослым людям, которых он желал бы просветить. Сказка же эта передается людям неспособным рассуждать, как самое достоверное описание мира и его законов, как самое верное ведение о жизни прежде живших людей, о том, что должно считаться хорошим и дурным, о существе и свойствах Бога и об обязанностях человека. Говорят о вредных книгах! Но есть ли в христианском мире книга, наделавшая больше вреда людям, чем эта ужасная книга, называемая «священной историей Ветхого и Нового завета»?.. Для человека, в уме которого вложено, как священная истина, верование в сотворение мира 6000 лет тому назад, потоп и ковчег Ноя, вместивший всех зверей, в троицу, в грехопадение Адама, в непорочное зачатие, в чудеса Христа и в искупительную для людей жертву его смерти для такого человека требования разума уже не обязательны, и такой человек не может быть уверенным ни в какой истине. Если возможна троица, непорочное зачатие, искупление рода человеческого кровью Христа, то всё возможно, и требования разума не обязательны… Человек, которому в детстве внушены бессмысленные и противоречивые положения как религиозные истины, если он с большими усилиями и страданиями не освободится от них, есть человек умственно больной. Такой человек, видя вокруг себя явления постоянно движущейся жизни, не может уже не смотреть с отчаянием на это движение, разрушающее его миросозерцание, не может не испытывать явного или скрытного недоброжелательства к людям, содействующим этому разумному движению, не может не быть сознательным поборником мрака и лжи против света и истины… Что может быть безнравственнее того ужасного учения, по которому Бог злой и мстительный наказывает всех людей за грех Адама и для спасения их посылает своего сына на землю, зная наперед, что люди убьют его и будут за это прокляты… и что тех, кто не верит в это, тех Бог казнит вечными мучениями».