Почему уже в первый день продаж билетов на поезд нормальных мест уже нет?

Возможно бронируют заранее, или, как говорится, для своих придерживают.

Первый день продажи билетов за 60 дней до отправления в 8:00 по Москве...
Возможно турфирмы скупают или брони разные...
Сначала пускают в продажу наименее продаваемые места... Например в двухэтажных составах сперва выставляют в продажу нижний этаж...

Люди покупают через интернет, там в очереди стоять не нужно.

лучшие места держат для льготников. И несколько раз замечала, что на сайте ржд билетов нет-а в кассе есть

Нет, придерживать не могут. Если направление или конкретный поезд пользуется спросом, то люди ждут начала продаж и ночью берут билеты через Интернет. А массово могут турфирмы скупать. У них свои договорённости с РЖД, возможно.

Возможно Вы опоздали и билеты проданы за 90 дней, а не за 60. Я вчера в 8.00 брала до Новороссийска, билеты были любые (на июль).

Никогда не сталкивалась с отсутствием мест, в первый день продажи приезжала в центральную кассу и брала, что мне надо

Уже несколько лет подряд до начала продажи (раньше это было за 45 дней, в прошлом году за 60 дней, а в этом году - за 90 дней) ввожу данные паспортные на себя и детей на какой-нибудь "вчерашний" рейс... ровно в 8-00 только загружается обновление - выбираю места и ввожу "купить" (паспортные данные уже введены и "запомнены")... только таким образом берем необходимые нам места на поезда южного направления летом...