Смена на работе начинается в 12:00, но руководитель группы сказал, что в 11:55 все должны быть на работе для собрания.

ТАК МОЖЕТ БЫТЬ.
Если у вас на работе счёт времени ведётся с точностью до минуты - это можно только приветствовать. Не знаю специфики работы вашей организации, но то, что дисциплина здесь на высоте - это несомненно. Вам распорядились выйти на работу всего на 5 минут раньше установленного времени, причём с целью, затрагивающей интересы всего трудового коллектива (а вы работаете именно в коллективе, не на себя лично, как ИП) - проведения собрания. Хотите сказать, что заставили работать сверхурочно 5 минут? Смею заверить, что это не так. Существует понятие "Обычаи делового оборота" (ст. 5 ГК РФ) - именно на те случаи, когда каждую мелочь прописать в законодательстве невозможно, да и не нужно. Попробуйте обратиться с таким заявлением в суд - судья просто оставит иск без рассмотрения ввиду его незначительности. А то, что "вычтут 5% от премии" - ничего противозаконного нет. Это не является дисциплинарным взысканием, заработная плата, указанная в вашем трудовом договоре, не пострадает, а платить или не платить премию - это прерогатива работодателя.

С руководителем нужно себя вести вежливо и пунктуально
http://www.youtube.com/watch?v=5mnkaAnmCGc

Работать надо по режиму предприятия. И если смена начинается с 12:00, то всегда было так, чтобы работник приходил до начала смены для приемки смены (оборудования и т. д.) . Значит, правильно требуют!

правильно говорит начальник!