Как грамотно поступить в такой ситуации?

Радочка, с Вашей работой уже всё понятно, работодатель просто набирает людей, не знающих свои прав, и через время кидает их на деньги различными способами. С Вами выбрали такой способ- обвинение в утере документов. Увольняйтесь оттуда и идити в трудовую инспекцию.

Стойте на своем. Пусть докажут.

Засудить их там всех

Бремя доказательства лежит на утверждающем.
Утверждают, что передали документы - пусть докажут. В следующий раз будут передавать документы под подпись. Если они не ввели до сих пор этого правила - это их проблемы.

Вообще, при получении документов положено расписываться. Если у вас в компании такого не заведено, то это контора «рога-копыта» и ничего удивительного, что документы пропали. Такими темпами, их с одинаковым успехом могли потерять Вы, сотрудники, которым Вы их передали, Вам даже могли их не дать изначально. Если никаких доказательств того, что документы были Вам переданы нет, то складывается ситуация- Ваше слово против их слова. Чтобы Вас обвинить, нужны доказательства вины- Ваши росписи о том, что Вы эти документы получали или записи с камер. Если ничего этого нет, а Вам просто не выплачивают зарплату, прямая дорога Вам в трудовую инспекцию. И работу лучше нормальную поискать, но это дело Ваше.

У вас нигде не расписываются за документы, не при получение, не при вручении ?

Курьер всегда при передачи посылки (документов, письма и т. д.) требует с получателя фамилию, число, время доставки и подпись. Если все это есть нет никаких вопросов.

а где Акт передачи документов? или ты просто в руки отдала и ушла?

Взять копии не суждено?

Обращайтесь в трудовую инспекцию, прокуратуру и суд для защиты своих прав. Администраторы пусть предоставят документы, подтверждающие, что они вам лично передали эти документы. Плюс в офисах сейчас везде ведется видеонаблюдение.