как оформить договор купли- продажи, если продавец и покупатель живут в разных гродах.

по доверенности.

Я не юрист, но сама оформляла сделку. Вам надо встретиться в городе где продаёте или же через агенство, но покупатель должен же договор хоть с агенством заключить на представление его интересов. А вообще без покупателя или хотя бы его законного представителя ни куда.

Обязательно встретиться и подписать договор, акт примема передачи, подать документы на госрегистрацию, передать ключи и получить деньги, написать расписку.
Если ехать совсем невозможно, можно выслать доверенность на эти действия на своё доверенное лицо (человека и гражданина)

Или приехать по месту покупки, или производить сделку по доверенности.

через проверенное агенство, проверить юристом

Либо предоставить доверенность, либо ехать самим.

Смотря чего?
Если недвижимости - через поверенного, если простой товар и Вы знаете друг друга - подпишите договор каждый в своём городе в простой письменной форме и обменяйтесь экземплярами.
Договор купли продажи считается исполненным с момента передачи товара покупателю.

Я представляла интересы продавца, не захотевшего ехать за тысячу километров, в сделке по купле-продажи квартиры. Все мои полномочия были четко прописаны в доверенности, заверенной нотариусом и присланной мне почтой из города N.

У продавца или покупателя должен быть представитель по нотариальной доверенности (это может быть кто то из родни или друзей) которые могут присутствовать на сделки и имеют право подписать договор купли-продажи и акт приема-передачи квартиры, также на получение денежной суммы за продажу квартиры.