при захвате с тв-тюнера картинка захватывается сначала цветная, а потом изображение становится ч/б

"...в моменте когда начиначинается другой фрагмент... "
Вот это самый главный фрагмент фразы (тьфу, ёпть, чуть ли не масло масляное получилось) .
Короче: смотри настройки ИЗНАЧАЛЬНОГО видео. Возможно, конфликтуют PAL/CECAM и NTSC. Т. е. сначала запись была в ПАЛ-е, а потом пошла НТСК (или наоборот) , отсюда и траблы. Прога захвата видео "на лету" чисто физически не успевает быстро переключиться с одного стандарта на другой (если такое автопереключение вообще возможно в данной проге или тюнере).