потолок с досок накрыли пленкой и три слоя кнафта 15 см, но в доме холодно, что делать.

Я так понимаю, что дом частный, а потолок укрыли пленкой со стороны чердака?
Ваш потолок довольно таки быстро сгниет, поскольку влага, присутствующая в воздухе жилого дома, будет конденсироваться на пленке и стекать на доски, вызывая появление плесени и гниение.
Самый простой вариант утепления - раскатать по потолку (со стороны чердака) рулонную стекловату. Вместо нее можно уложить маты из минеральной (базальтовой) ваты, но это дороже.
Можно уложить (даже приклеить) листы пенопласта и смазать их раствором (толщина слоя не менее 2-3 см) , состоящим из глины, песка и древесной стружки (или крупных опилок) . Опилки можно заменить рубленой соломой. Но это надо делать в теплое время года (сейчас долго сохнуть будет) .

Источник - личный опыт.

почему вы решили что виноват потолок? а как у вас настелен пол? А из чего стены? а какие окна? Площадь? и наконец скольки ватный котел?

отапливать дом не пробовали?

надо утеплять стены и пол