больничный надо оформлять. "начальник отпустил" - это вообще ни о чем. сегодня отпустил, завтра совершенно спокойно и законно уволит за прогул. прежде, чем уходить с работы, надо было определится: либо оформяете эти дни в счет отпуска или без содержания (как начальник разрешит) , либо идете в больницу. а теперь с начальством договаривайтесь, как лучше ваше отсутствие оформить.
а выплата премии законами не регулируется. скажется ваше отсутствие на работе на выплате премии или нет можно узнать только из локального нормативного акта (положения о премировании вашего предприятия)