Работник при написании заявления на отпуск может ли указать например с 14 по 25 марта? +

Правильно указывать не с какого по какое число, а количество календарных дней, на которые сотрудник уходит в отпуск.
К примеру: "Прошу вас предоставить мне очередной отпуск с 01 марта 2011г на 14 календарных дней"

Главное, чтобы первые 14 дней подряд отгулял, как написала Вам Евгения, а потом уже можно хоть по 5, хоть по 3 календарных дня брать, хоть все 42 дня сразу (по согласованию с руководством, естественно) ; а то, что отпуск нужно брать строго с понедельника по воскресенье, обязательно включая выходные, такого нигде в законодательстве не прописано, так что можно взять и с понедельника по пятницу, тогда выходные в расчёт не войдут.

На сколько дней предоставляете отпуск, если на 12 дней, то с 14 по 25 марта, если на 14, то с 14 по 27 марта. Отпуск считается по календарным дням.

Может. Отпускные будете считать за 12 дней, и делов-то. Главное, проследите, чтобы вторая половина отпуска была не меньше 14 дней. Отдыхать он будет в выходные 26 и27 "бесплатно", Вы на них не заглядывайтесь. Я знаю хитрых товарищей, которые отпуск пишут как раз на выходные, чтобы в зарплате не терять.
По поводу "должен". Если бы Вы вели кадровый учет и отправляли в отпуск "по учебнику", то и заявления от сотрудника Вам бы не потребовалось. Но раз уж у Вас учет с допущениями, то допускайте и то, что сотрудник уходит в отпуск на удобное ему количество дней.

По ТК РФ: отпуск 28 КАЛЕНДАРНЫХ дней, при этом 2 недели (14 дней отгуливаются безразрывно) оставшиеся 14 дней может оформлять как угодно, т. е. (можно) не включать выходные и праздничные дни.