Нет логической нейтрали

речь о КПП. остальное и так ясно из описания. датчик нейтрали нужно колхозить, ибо на вазах его в помине никогда не было.

Провод на датчик ручника не оборвало где-нибудь? Или петлю у блока сиги не перерезали?

Почитайте инструкцию на сигналку. там описывается процедура подготовки авто с МКПП для последующего автозапуска.
Смысл в том, что бы перед включением охраны - по шагово- на работающем двигателе был затянут ручник, далее выключается зажигание, двигатель работает, вы выходите из авто (двигатель работает - тут надо понимать, что выходя вы обязательно поставите в нейтраль ручку), далее закрываете дверь, далее включаете режим охраны и двигатель глушится.
Если не отключать охрану, не открывать двери, не опускать ручник, то автозапуск возможен!
По пути этого алгоритма сигналка должна видеть сигнал ручника, сигнал того что двигатель работает, сигнал того что открывается-закрывается дверь (концевик света в салоне) и после этого включается охрана.
Если в перечисленной цепочке есть сбой, то автозапуска не будет.
И судя по описанию дефекта у вас проблема с концевиком салонного света, скорее всего его не корректного подключения, возможно перегоревшей лампы салона или установленной светодиодной лампочки в салоне.
Не исключено окисление концевика ручника или окисление проводки в местах подключения проводов сигнализации к проводам автомобиля.

Автозапуск подключили через жопу, на датчик КПП не идет питание, когда выключено зажигание.