Количество внутренних жестких дисков влияет отрицательно на какие-нибудь параметры компьютера?

Только на потребление энергии. Зато увеличивает надежность системы.. . при правильном использовании.

проблем нет ни каких, только блок питания нужен по мощнее и охлаждение дополнительное

Загрузка Windows может быть немного дольше из-за конфликта жестких, например если у вас несколько жестких IDE и несколько SATA, скорость работы у них отличается и то не факт что будут проблемы, а так ничего отрицательного нет.

Не то что бы отрицательно, но влияние есть. Потребление энергии (нагрузка на БП) и выделение тепла. С первым проблема решается установкой более мощного БП, со вторым - установкой дополнительных вентиляторов. Жесткие диски очень чувствительны к нагреву, и при повышении температуры ресурс у них падает в разы.

Не замечено

Будешь больше платить за электроэнергию. Вывод надо подбирать БП чтобы хватало мощности. А также дополн кулеры, а это дополн шум

тяжелее становится )

количественно - конечно
падает производительность + перегрев

лагать ничего не будет, если вешать каждый бублик на свой интерфейс. на некоторых материнках до шести SATA разъемов. если мало - можно поставить PCI-контроллер, еще как минимум два разъема. а вот если повесить пару винтов на один IDE шлейф.. . великий упадок производительности налицо. при достаточной мощности БП никаких проблем с производительностью (при разумном количестве терабайт))

Становится Больше файлов и ты можешь закинуть больше файлов, но копм может иногда притормаживать потому что в нем стоит два жестких диска потребляют больше питания.
Комп будет лагать, а может и нет, но если у тебя очень навороченный компьютер.

только потребляют больше питания и всё