можно ли поменять 3-ёх комнатную квартиру площадью 69 кв.м. на 2-х комнатную квартиру и комнату в коммуналке?

можно, только не везде.
Но при этом учтите, что бесплатное оказание услуг (консультации, оценки) коммерческой организацией, в лице агентства недвижимости, первый и не последний признак нарушения российского законодательства.
Ещё один миф, распространяемый агентствами - ГАРАНТИЯ ЧИСТОТЫ СДЕЛКИ и выдача СЕРТИФИКАТОВ. После проведения сделки с заказчиком подписывается АКТ о выполненных работах и ОТСУТСТВИИ ПРЕТЕНЗИЙ - ЭТО ОСВОБОЖДАЕТ ИСПОЛНИТЕЛЯ от всякой ответственности. В лучшем случае, представители агентства выступят в суде как свидетели... .
Большинство агентств, например, в Москве обманывают не только своих сотрудников - агентов, но и своих клиентов.. .
И, чем известнее агентство, тем больше у него опыт в обмане.. .
Заявляя, например, о 1-3 процентах комиссионных, используя серые схемы, берут не менее 10-15% (300-700 тыс. руб. ) за сопровождение сделки, при этом, сотрудник агентства получает в 4-5 раз меньше.
Бывают случаи, когда продавец или покупатель, экономя на риэлторе, пользуясь бесплатным советом первого встречного "эксперта" оставались ни с чем.... во многих агентствах есть сотрудники, которые умышленно "шутят" над "продвинутыми " пользователями интернета и ...
вспомните обманутых дольщиков... .
Поэтому советую найти риэлтора через знакомых.

Можно почему нет

конечно можно. отвечающие, что понятия обмен не существует глубоко ошибаются, или не в курсе. муниципальное жилье как раз попадает под понятие обмен.
ваш вариант практически нормален. то что вы хотите получить возможно в результате обмена, но вы должны определиться какой район вам нужен, на какую двушку вы расчитываете.
но спешу предупредить, что поиск обмена займет много времени.

Зависит от вас. Ищите желающих и совершайте сделку.

Да, вполне возможно.

Да, муниципальное жилье Вы можете разменять по своему усмотрению и договоренности с хозяевами другого муниципального жилья. Если квартира в собственности, то можно также разъехаться по договорам мены или купли-продажи. Поинтересуйтесь ценами на рынке недвижимости Вашего города и сориентируетесь в доплатах.

если в Вашем городе существуют еще комуналки. . ТО без проблем.. .
Вот если бы вы хотели трешку обменять на 2-шку и 1-шку без доплаты - то нереально. а на коммуналку - можно.

Сейчас не существует такого понятия, как "обмен жилплощади". Квартира продаётся, а затем приобретается жильё, соответствующее пожеланиям. Всё будет зависеть от стоимости трёхкомнатной квартиры и реально вырученной за неё суммы. Хватит на двухкомнатную и комнату в коммуналке или придётся доплачивать - это уже от обстоятельств будет зависеть.

3-х комнатная квартира 69 кв. м. -это явно не новострой, скорее всего панельная девятиэтажка (504 серия, корабль) (ну или кирпич) , а такую квартиру, скажу по практике, разменять на двушку и комнату тяжело, либо будет плохая двушка-брежневка или хрущевка и маленькая комната, либо если у вас хороший район, то есть смысл подыскивать варианты в районе подешевле.