Если отец с матерью прописаны в разных местах, куда нужно прописывать новорожденного?

В соответствии со ст. 20 ГК РФ местом жительства несовершеннолетнего ребенка до 14-ти лет признается место жительства его законных представителей (в данном случае матери или отца) .
Вывод - Вы вправе зарегистрировать ребенка как по месту жительства матери, так и по месту жительства отца.
Удачи!

По желанию, куда захотят родители, как они договорятся между собой.

Подумайте сами куда вам выгоднее его прописать. По закону вы можете его зарегистрировать по месту жительства отца или матери причем при этом не нужно согласие остальных взрослых членов семьи!!!

там где договоряться родители либо у матери либо у отца

Раньше обычно с матерью прописывали .

К любому из родителей.

наверное по желанию...

По месту прописки любого из родителей.

Куда, Вам удобнее, к мужу или к Вам. Ребенок может быть прописан только вместе с кем-то из родителей, т. е. прописать сына к любимой бабушке, если вы там не прописаны, вы не сможете. Зато, прописывая ребенка к себе, вы можете не спрашивать согласия у остальных жителей квартиры. В разных ЖЭКах требуется разное количество бумажек, поэтому пишем программу максимум. Если родители прописаны в разных местах, вам понадобятся:
Паспорт отца
Паспорт матери
Свидетельство о браке
Копия свидетельства о браке
Свидетельство о рождении
Копия свидетельства о рождении
Заявление матери
Заявление отца
Копия финансово-лицевого счета матери
Копия финансово-лицевого счета отца
Выписка из домовой книги матери
Форма №6 (выдается и заполняется на месте)

Согласия собственника на прописку новорожденного ребенка ?
Несовершеннолетние дети могут прописываться либо только вместе с родителями. При отсутствии родителей - с разрешения опекуна при обязательном личном присутствии опекуна и ребенка.
Прописка ребенка осуществляется на основе заявления родителя.
Если ребенок прописывается вместе с обоими родителями или только с матерью (отдельно от отца) то ребенок прописывается на основе заявления матери.
Если ребенок прописывается вместе с отцом (отдельно от матери) , то от матери ребенка требуется нотариально заверенное заявление, которое можно написать и лично в ЖЭКе.
Особенности прописки новорожденных:
До одного месяца после рождения новорожденный прописывается на основе заявления матери.
После одного месяца после рождения новорожденный прописывается на основе заявления матери и справке с места жительства отца.
Вы имеете право зарегистрировать ребенка на Вашу жилую площадь без согласия других членов семьи - сособственников в соответствии со ст. 70 ЖК РФ.

на будующее, выгоднее к отцу чтоб ребенок имел право на площадь.

Нет в даном случае поняти янужно. Куда сочтете правильным, туда и прописывайте.

На счет "нужно" не скажу, а вот МОЖНО и к отцу и к матери... на ваше усмотрение.

Плюс требуется согласие собственника квартиры в письменном виде и его присутствие. Таков нынче закон. Кроме того, письменное согласие от отца, что он не против.