Как узнать зарегистрирован ли договор на аренду жилого помещения на подоходный налог?

Подоходный в любом случае платится.. Даже, если на месяц сдал.. В Конце года отчитаешься.. Зарегистрирован - не зарегистрирован..

Ни на какой подоходный налог договор аренды жилья не регистрируется, нет такой нормы в законе.

Нет вообще такого- регистрации на подоходный налог, как нет и подоходного налога.
А раз нет, то печати не ставятся.
------------------
Бывает НДФЛ у физлиц- налог на доходы физлиц.
Бывает договор найма жилого помещения, когда наниматель- физлицо, а наймодатель- физлицо или юрлицо.
Бывает регистрация обременения по договору найма жилого помещения если договор не менее, чем на год. Регистрация в ЕГРН в Росреестре.
В налоговой договор найма не регистрируется.
Наниматель, получая доход от найма, раз в год подает в налоговоу декларацию о доходе, считает и платит НДФЛ.
Как деклрацию- см. на официал. сайте налоговой.

Вам то зачем. Если сдаёте, то неуплата -нарушение и это знаете, если снимаете и отомстить, то это не так просто. Отметку на договор в налоговой не ставят.

Вы бы обозначили, вам чего надо? Трудно понять.
Заложить хотите? - так не парьтесь - пустое.

Собственник не обязан отчитываться перед Вами об уплате налогов. Не платит - правильно делает. Значит, не совсем глуп.

Печати ставятся если сторона договора ИП, юр. лицо, гос. орган или ОМСУ.
У граждан личных печатей нет. Регистрации на налог тоже пока еще не придумали.