по отпуску сотрудника

Согласие сотрудника, если он не относится к категории работников которым отпуск предоставляется в удобное для них время, вы спрашивать не обязаны.
Отпуск за второй и последующие годы может быть предоставлен в любое время рабочего года и ни где не сказано, что "интервал" между отпусками должен быть обязательно через 6 месяцев.
Так, что в данном случае нарушения ТК РФ нет.
А на случай, если она уволится не доработав год, за который отгуляет отпуск вы, согласно ст.137 ТК РФ, произведете удержание отпускных за неотработанное дни отпуска.

вообще то) обычно.. ) для нового графика отпусков, собираются Заявления от всех сотрудников "Я Иванов Иван Иваныч планирую свой основной, ежегодный, оплачиваемый отпуск (или часть отпуска) с________ по_______ на 28 дней. ( или 14 дней если части с__ по__) Заявления согласовываются, ставиться на каждом виза (или несколько) Заявления начинают собирать за месяца полтора -два до нового года ...Я не знаю как у вас, но я и все мои ОКашники это делают в обязательном порядке.

Статья 122. Порядок предоставления ежегодных оплачиваемых отпусков

Оплачиваемый отпуск должен предоставляться работнику ежегодно.

Право на использование отпуска за первый год работы возникает у работника по истечении шести месяцев его непрерывной работы у данного работодателя.

Отпуск за второй и последующие годы работы может предоставляться в любое время рабочего года в соответствии с очередностью предоставления ежегодных оплачиваемых отпусков, установленной у данного работодателя.

при расчёте высчитываете переплаченные отпускные да и всё.