"Вычесть из зарплаты" вопр. по трудовому праву...

Удержания могут производиться в размерах, не превышающих установленных размеров законодательством:
При полной и неполной материальной ответственности по результатам инвентаризации (при недосдаче) ;
возмещения неотработанного аванса, выданного работнику в счет заработной платы;
погашения неизрасходованного и не возвращенного аванса, выданного в связи со служебной командировкой или переводом на другую работу в другую местность, а также в других случаях;
возврата сумм, излишне выплаченных работнику вследствие счетных ошибок либо в случае признания органом по рассмотрению индивидуальных трудовых споров вины работника в невыполнении норм труда или простое;
при увольнении работника за неотработанныедни отпуска;

Наверное не "вычесть", а удержать.
Всм об удержаниях из зарплаты смотрите в ТК РФ в статьях 137, 138
http://www.consultant.ru/popular/tkrf/14_28.html#p2098
Удачи

Если работник является материально-ответственным лицом и по его вине произошла порча вверенного ему имущества или пропажа материальных ценностей руководство в праве удержать некую сумму из оклада сотрудника. Если работаете по договору то нужно внимательно прочесть договор и посмотреть что там сказано о порядке оплаты. В общем для начала уточните по чему и за что была удержана часть вашей зарплаты.

За прямой материальный ущерб может удержать сумму, если она не превышает вашего среднего раработка. Если превышает - то либо по вашему добровольному волеизъявлению вы внесете в кассу, либо РД будет действовать через суд.