При инвентаризации возникла недостача.См.внутри.

ХО-хо, парень! ! Да из тебя прямо лоха делают! ! А не похрену ли тебе чья-то зарплата, если за всех с тебя конкретно стригут?
Ну подпиши, а кто возмещать будет? А возникла недостача почему? А почему 40 тыс. , а если завтра 500 тыс. ? ты, батенька, попробуй подумать головой все же. Так бомжами и становятся. Ты или порядок наведи, или вали оттуда подобру- поздорову.

А инвентаризация проводилась комиссией, которая назначена приказом работодателя? В Вашем присутствии? Результаты инвентаризации оформлены инвентаризационными описями и сличительными ведомостями?

На основании инвентаризационных описей и сличительных ведомостей по итогам инвентаризации устанавливается недостача либо излишек материальных ценностей.

Методические указания по инвентаризации имущества и финансовых обязательств, утвержденные Приказом Минфина России от 13.06.95 № 49, регулируют порядок проведения инвентаризаций.

Методическим указаниями определено, что инвентаризация должна проводиться с обязательным участием всех материально ответственных лиц.
Инвентаризацию проводит комиссия, назначенная приказом работодателя. С этим приказом ознакамливается материально-ответственное лицо.
Во-вторых, до начала инвентаризации материально-ответственное лицо сдает товарно-денежный отчет на дату инвентаризации, а на инвентаризационной описи расписывается в том, что все материальные ценности, находящиеся у него в подотчете, оприходованы, выбытие оформлено накладными, выручка сдана в кассу.
В-третьих, по итогам инвентаризации при выявлении расхождений фактического наличия материальных ценностей с данным бух. учета (недостачи или излишки) у материально-ответственного лица истребуется объяснительная о причинах расхождений (недостач или излишков) .
И лишь только ПОТОМ работодатель может принимать решение об удержании недостачи с виновного лица.

В Вашем случае такие условия соблюдены? ! Если нет - то можете жаловаться в Гострудинспекцию, прокуратуру.

естественно не подписываться с тем с чем Вы не согласны...

Необходимо создать другую комиссию по проведению повторной, либо выборочной инвентаризации. Найтти точные причины недостачи. Смотря какой договор индивидуальный или коллективный.
Смотря какой вид текущего учета. У нас, например в магазине числился товар, который нам и не привозили вовсе.. Зависит от "чистоплатности" администрации. не из-за вас не получат ззп, а в следствии текущих внутренних производственных причин.
Надо оспаривать каждую позицию недостачи. На что есть и ГК РФ и Административный кодекс, и Федеральные законы. Точнее не подскажу, в связи смены деятельности.