начисления заработной платы

когда кто то получает доход, нужно платить налог. кроме случаев освобождения от уплаты налога.

Правильно, в соответствии с Налоговым кодексом РФ. Налог на доходы физических лиц со всех видов доходов ОБЯЗАН уплачивать работник. Работодатель уплачивает страховые взносы в пенсионный фонд, соцстрах, федеральный и территориальный медицинские фонды.

Вычет в13% верен, это требование закона.

Если в оклад включены все надбавки, то это вы правильно заметили, нарушение.

весь доход облагается налогом 13% (НДФЛ) , даже если вы бесплатно обедаете, то сумма обеда тоже подлежит налогооблажению. а если в договоре написано, что все надбавки включены - значит так оно и есть.
вас приняли на оклад 20000, вы за него расписались, какие проблемы?

Уральский коэффицент составляет 15%, а по закону вычет составляет 13%.
Следовательно к вашей зароботной плате должны прибавляться 2% (15%-13%=2%)
Из этого следует если заработная плата составляет 20000 рублей, то выплачиваться должно 20400 рублей, так как 2%= 400 рублей.

13% это налоговая ставка на любого гражданина. В вашем случае работодатель отчисляет из ВАашей з/платы эти 13% и переводит в налоговую службу. Нарушений со стороны работодателя нет. Другой случай, если в ваш оклад входит весь состав компенсаций, надбавок, то эта сумма не облагается налогом. Налогом облагается только ставка. В данном случае за разъяснением этого вопроса, обратитесь в ГИТ