как должны начислять рассчет?

Для точного ответа нужно знать ваш средний заработок и за какой рабочий год вы использовали отпуск. Из ваших данных получается, если вы взяли отпуск в апреле, а вышли на работу в июне, то отпуск составил, как минимум 42 дня. Но в любом случае, без вашего согласия с вас могут удержать только сумму за использованный отпуск авансом, пропорционально отработанному времени и то при определенных условиях: если вы уволены по п. 8 ст. 77 ТК РФ или п. 1,2,4 ст. 81 ТК РФ, либо по п. 1,2,5,6,7 ст. 83 ТК РФ -удержания не производятся. Если вы оспариваете сумму удержаний, то работодатель вправе это сделать, только по решению суда.

Если Вы в отпуск ходили ежегодно, то из Вашего письма следует, что на работу Вы были устроены 26.01.2006г. Отпуск по ТК РФ положен в количестве 28 к. дней за каждый год.
Я не знаю за какой период Вы ходили в отпуск, но рассмотрим 2 варианта:
- за период работы с 26.01.2010-25.01.2011г. значит с Вас ничего не должны удерживать, да еще должны выплатить компенсацию за неиспользованный отпуск ;
а если ВЫ ходили за период с 26.01.2011-25.01.2012, то получается с Вас должны удержать где-то за 20 к. дней. По деньгам -это бухгалтерия. Но по моим приблизительным расчетам, так и есть 16 т. руб.