Почему не дают один экземпляра договора на руки, говоря при это, что мол коммерческая организация. что делать?

Отправьте письменный запрос работодателю.
В соответствии со ст. 62 ТК РФ по письменному заявлению работника работодатель обязан не позднее трех рабочих дней со дня подачи этого заявления выдать работнику копии документов, связанных с работой (копии приказа о приеме на работу, приказов о переводах на другую работу, приказа об увольнении с работы; выписки из трудовой книжки; справки о заработной плате, о начисленных и фактически уплаченных страховых взносах на обязательное пенсионное страхование, о периоде работы у данного работодателя и др.) . Копии документов, связанных с работой, должны быть заверены надлежащим образом и предоставляться работнику безвозмездно.

обязаны дать. требуйте.
ст 67 ТК РФ Трудовой договор заключается в письменной форме, составляется в двух экземплярах, каждый из которых подписывается сторонами. Один экземпляр трудового договора передается работнику, другой хранится у работодателя. Получение работником экземпляра трудового договора должно подтверждаться подписью работника на экземпляре трудового договора, хранящемся у работодателя.

требования ТК РФ обязательны для всех работодателей, не зависимо от того коммерческая или иная это организация.

какого договора?

Требуйте экземпляр своего договора. Если работодатель при оформлении на работу нарушает закон, стоит ли продолжать с таким отношения?

В настоящее время ст. 67 ТК РФ содержит правило, согласно которому получение работником экземпляра трудового договора должно в обязательном порядке подтверждаться подписью работника на экземпляре трудового договора, хранящемся у работодателя.
Если предприятие с самого начала нарушает Ваши права, так может не стоит заключать с таким лицом трудовые отношения? В любо случае закон на Вашей стороне, используйте все способы защиты и самозащиты своих прав)