Компенсация за 3 года работы.

а с чем вы собираетесь обращаться? у вас есть документальные доказательства работы? свидетели, которые подтвердят вашу трудовую деятельность? если есть, то обращаться можно в гострудинспекцию или в прокуратуру. если нет, то и разговаривать с вами ни кто не будет.
работодателю грозит штраф за несоблюдение трудового законодательства, за неуплату страховых взносов, за непредставление отчетности.
вам - ст. 198 УК РФ, вы ведь, как я понимаю, в течение 3х лет получали доход, а НДФЛ см него не уплачивали. если вы в суде докажете, что получали какие-то суммы денег в течение нескольких лет + всё, что вы хотите дополнительно с работодателя получить, то со всего этого придется 13% НДФЛ уплатить и штраф за несвоевременную уплату.

если бы так просто было наказать работодателя и при этом выйти "сухим из воды", у нас в судах было бы не протолкнуться, т. к. пол-страны точно в такой же ситуации находятся.

Уважаемый Алексей! Нет у Вас законного основания требовать компенсаций. И для работодателя Вашего нет штрафных санкций за, то что он не делал отчислений. А зачем? Юридически Вы у него не работали. А фактически... Попробуйте это доказать в суде.

если вы официально не трудоустроены, кто же будет отстаивать ваши права? Чем вы будете доказывать, что это ООО вам что-то должно?

Попробуйте обратиться в Государственную инспекцию труда. Но надежды мало