Имеют ли юридическую силу документы переданные по факсу? Дайте ссылку на нормы права

Могут, факсимильная подпись даже есть

Имеют, если в договоре к которому они относятся, прямо оговорена юридическая сила сканированных и факсовых договоров.
В Вашем же случае, все зависит от письменных указаний руководителя.
Закона на это нет, так что бух права.

Согласно ст. 9 ФЗ "О бухгалтеском учете" каждый факт хозяйственной жизни подлежит оформлению первичным учетным документом. Не допускается принятие к бухгалтерскому учету документов, которыми оформляются не имевшие места факты хозяйственной жизни, в том числе лежащие в основе мнимых и притворных сделок.

Далее, согласно той же статье 9 первичный учетный документ составляется на бумажном носителе и (или) в виде электронного документа, подписанного электронной подписью.

Таким образом, вариант 1 для Вас составлять первичные документы в электронном виде и подписывать квалифицированной ЭЦП.

Но допустим, Вам не хочется так делать, Вы хотите составлять именно документы в бумажном виде.

Тогда собственно и возникает вопрос - документ переданный по факсу, соответствует ли он требованиям ст. 9 федерального закона?

Но для начала, что такое документ переданный по факсу? По сути это копия исходного документа воспроизведенная машинным способом.

Ст. 9 не содержит какого-либо регулирования (запрета или разрешения) использования копии первичного документа в целях бухучета.

Таким образом однозначного вывода основанного на букве закона сделать нельзя. Можно только сделать некий вероятностный вывод, ориентируясь на мнение правоприменительных органов.

Например, вот что написано в Письме Минфина от 20 декабря 2000 г. N 16-00-14/820:

Несмотря на то, что соглашением сторон может быть предусмотрена передача документов между сторонами - участниками сделки в форме факсимильной копии (п. 2 статьи 160 Гражданского кодекса Российской Федерации) , подобный документ может быть использован только в оперативном управлении для принятия управленческих решений и не может быть принят к бухгалтерскому учету при отражении хозяйственных операций в качестве оправдательного документа, так как факсимильная копия не гарантирует действительность на ней подписи.

Следовательно, я все таки бы принял сторону Вашего бухгалтера (у нее нормальный консервативный подход) . А если есть такая необходимость, то в соответствии с законом можно было бы использовать квалифицированную ЭЦП и электронный документооборот.