Есть ли шансы у сотрудницы закрывающегося ИП уйти в декрет с нормальными выплатами от ФСС?

Если в течение 24 месяцев, предшествующих году, в котором начнется декретный отпуск, вы трудились, то размер пособия будет определен исходя из размера среднего дневного заработка за этот период. Для этого вся сумма начисленных выплат за два предыдущих года будет поделена на общее количество календарных дней в этом периоде (за исключением периодов, не входящих в расчетный: периодов временной нетрудоспособности, отпуска по беременности и родам и других периодов), а затем умножена на количество дней предстоящего отпуска по беременности и родам
Более того, напоминаю о том, что при ликвидации организации/закрытии ИП работнику сохраняется средний заработок на 3 мес. после увольнения, если гражданин не устроился на работу снова (однако, для этого необходимо встать на учет в качестве безработного).
Поэтому не вижу особых препятствий для «нормального» пособия.

все зависит только от ее заработков за предыдущие 2 года

В Законе об обязательном социальном страховании женщины – ИП не включены в список лиц, которым положены выплаты по беременности и родам, ввиду отсутствия договора с ФСС.

Шансы есть, если была полная оплата по договору страхования.

- Пособие по беременности и родам - 27455,4 руб. за 140 дней отпуска.
- Единовременное пособие за постановку на учет в ЖК в ранние сроки беременности (до 12 недель) -543,67 руб.

Приказом Минтруда РФ от 06.05.2014 № 290н Утвержден регламент осуществления ФСС РФ выплаты застрахованным лицам пособия по временной нетрудоспособности в отдельных случаях. У Вас же есть трудовой договор с работодателем ИП? По-моему, Ваш случай подпадает под действие этого регламента.
К таким случаям относятся: прекращение деятельности страхователем на день обращения застрахованного лица за пособием по временной нетрудоспособности, отсутствие возможности его выплаты страхователем в связи с недостаточностью денежных средств на его счетах, а также отсутствие возможности установления местонахождения страхователя и его имущества, на которое может быть обращено взыскание, при наличии вступившего в законную силу решения суда об установлении факта невыплаты таким страхователем пособия по временной нетрудоспособности застрахованному лицу.
Заявителями на получение выплат являются лица, подлежащие обязательному социальному страхованию на случай временной нетрудоспособности и в связи с материнством, или их представители.
Регламентом определено, что территориальный орган ФСС РФ назначает и выплачивает пособие в течение 10 календарных дней со дня поступления необходимых документов.