как перевести на русский: nuclear purine-box regulator? Что это за "purine-box", и в чем его смысл?

Это в районе старта транскрипции (в области промотора) – пурины, часто «САТ» . А речь идет о регуляторах этой области (т. е. о транскрипционных факторах) , которые либо связываются, либо не связываются с промотором, тем самым ослабляя/усиливая транскрипцию

есть такой алкалоид
НаименованиеПурин (Purine)
ФормулаC5N4H4
Молекулярная масса120,11 г/мол

в 1953 году о нём упоминалось в знаменитой работе Уотсона и Крика, которая позволила создать современную биофизическую теорию атомной структуры нуклеиновых кислот.
Оказалось, что, молекула ДНК – это полимер,
атомные цепи которого образуют двойную спираль, навитую на цилиндр с диаметром порядка 20 ангстрем.
Полимерные цепи в молекуле ДНК состоят попеременно из молекул сахара и молекул фосфорной кислоты.
В развернутом виде молекула ДНК напоминает лестницу, состоящую из отдельных звеньев (хотя в действительности она скручена в спираль) . Число звеньев в молекуле может достигать порядка 105.
Молекула сахара, типичного углеводородного соединения в форме дезоксирибозы с химической формулой С5Н10О4.
Химическая формула фосфата имеет вид НРО3.

Кружки на рис. 105а означают фосфаты, а пятиугольнички – молекулы сахара.
Последние соединены с пуриновыми и пирамидиновыми основаниями, вид которых изображен на рис. 105в.
Общая формула пурина – С5N4Н4.

В нашем случае из возможных модификаций пурина существенны две:
аденин: NC5H4N4 (рис. 105г) ,
гуанин: NC5H4ОN4 (рис. 105д) ,
из производных пирамидина с общей формулой С4N2H4 нам нужны только две модификации:
цитозин: NС4Н4ОN4 (рис. 105д) ,
тимин: NC5H4ON4 (рис. 105г).