Я правильно понял, что чтобы корабль тонул строго горинзотально, то с него нужно убрать все стены и потолки?

даже при полном отсутствии палуб, переборок будет уклон на ту сторону, откуда поступает вода.
Чтобы этого избежать нужны идеально равные пробоины с двух сторон. А скорее даже с четырёх - по обоим бортам + в носу + в корме.
А также обеспечить равномерный выход воздуха через верхнюю палубу. ТОже разнести отверстия.
потом ещё надстройки и мачты начнут давать наклон. ветер влиять.
так что утопить корабль аккуратно, на киль - та ещё задача .

Нет, это Вы поняли неправильно.
Даже если убрать все внутренние переборки, обычный корабль в подавляющем большинстве случаев при затоплении в какой-то момент перевернется. Эти вопросы рассматриваются в теориях плавучести и остойчивости.
А вот если все переборки на месте и их количество и расположение рассчитаны правильно, то капитан может удерживать судно от крена и переворачивания довольно долго (это называется затопление на ровном киле) и достигается подачей забортной воды в отсеки, противоположные затопляемым естественным путем.
Но и в этом случае (как и в "идеальном" случае, описанном в ответе Трям) судно должно (может) при затоплении перевернуться. Дело в том, что у обычных надводных судов центр тяжести находится ВЫШЕ центра плавучести (точка приложения Архимедовой силы). При крене центр плавучести смещается, и возникает пара сил, возвращающая судно в правильное положение (подробнее - смотрите диаграмму остойчивости корабля). При затоплении эти центры сближаются, в какой-то момент они оказываются в одной точке, и судно приходит в положение безразличного равновесия, когда восстанавливающая сила при любом отклонении равна нулю.

Чаво? А это как: тонуть строго горизонтально? Может тянуть?

закрепить-нагрузить и ждать прилив