Как защитить свой корабль от греческого огня?

Да сколько угодно. Например,
- воевать на стороне греков
- не воевать с греками
- держаться на дистации, превышающей использования г. о.
- атаковать в первую очередь оружие с г. о.
- использовать тушение г. о. (например, пену морскую)
- договориться о неиспользовании ОМП
- атаковать из под воды
- подходить со слепого для г. о. сектора

Конечно. Построить корабль из железа, разбить на отсеки с огнестойкими переборками, оснастить уплотненными люками. Поставить оборудование для пожаротушения, сформировать и обучить пожарную команду

Надо иметь на борту запас греческой воды, греческой земли и греческого воздуха... И немножко греческого пятого элемента...

Подводная лодка будет эффективнее всего)

Если не удаляться от технологий соответствующей эпохи, то навскидку:
- Убрать паруса, посадить гребцов и рулевых под сплошную палубу, обшить надводную часть вымоченными шкурами, мешками с мокрыми водорослями или, если совсем богато, медными листами на относе. Иметь запас пожаротушащих веществ (балластные мешки с песком, можно попробовать соду или другие карбонаты, имитировав современные огнетушащие порошки) и средств, выученную команду для тушения.
- Не допускать противника на расстояние выстрела горючей смесью, иметь артиллерию (дальнобойные баллисты, те же огнеметы), вспомогательные суда, устраивать плавучие заграждения.

Сейчас или в прошлом?

строить корабли из железа

Не плавать в Грецию =)

пропитка отталкивающая его а ещё лучше не приближаться туда откуда он достанет..

нужно включить энергитическое поле, силовые щиты,

Вы застряли в прошлом....

Да, обмотайте его фольгой