Имеют ли право в магазине отказать в расчете по банковской карточке,ссылаясь на отсутствие у покупателя документа с фото

В законе нет прямого требования обязательно предъявлять паспорт при оплате услуг банковской картой.

ст. 847 ГК РФ

При этом существует письмо Банка России со следующими рекомендациями:

«При использовании банковской карты для оплаты товаров и услуг кассир может потребовать от владельца банковской карты предоставить паспорт, подписать чек или ввести пин. Перед набором пин следует убедиться в том, что люди, находящиеся в непосредственной близости, не смогут его увидеть. Перед тем как подписать чек, в обязательном порядке проверьте сумму, указанную на чеке».

В момент оплаты у продавца простые инструкции: определи, кто перед тобой — владелец карты или нет. Если нет, по внутренним правилам он должен принять меры, чтобы защитить деньги клиента банка от возможного мошенничества.

Что делать, если попросили паспорт?
Покажите паспорт или идите в другой магазин. Спор с продавцом, скорее всего, будет бесполезен.

Нет запрета требовать удостоверение личности пр расчетах платежными картами, но нет и обязанности.
Статья 426 ГК РФ. Публичный договор
2. Цена товаров, работ и услуг, а также иные условия публичного договора устанавливаются одинаковыми для всех потребителей, за исключением случаев, когда законом и иными правовыми актами допускается предоставление льгот для отдельных категорий потребителей.
По опыту расчетов платежными картами скажу, что во всех торговых организациях разные правила - где-то требуют документы, где-то - нет

нет не имеют права. это Ваша личная собственность