Я читал, что если с утра на голодный желудок бегать, то мышцы меньше становятся, так как организм берет энергию из мышц.

Ну да. При нехватке энергии распадается белок. Только вначале надо исчерпать глюкозу, глюкозные запасы и напрячь использование запасов жира.
Дистрофия называется. Видел фотки из Освенцима? - это оно.

Да но небольшие запасы гликогена Есть и в печени и в мышцах! просто жиросжигание начнется немного ранее! а мышцы начнут гореть если сильно недоедать и бегать долго более получаса

с утра кардио можно делать натощак, если потом поесть, если боишься утром делай в любое другое время, главное что бы разрыв между тренировкой с железом и кардио был как можно больше

Оперативное получение энергии идёт из углеводов. В мышцах надо пополнять белок, но это процесс более долговременный. То есть, есть белкИ до бега или после бега для мышц не важно. Важно другое: если перед бегом принимать белковую пищу, то часть энергии будет расходоваться на её переваривание и бегать будет тяжелее. Лучше непосредственно перед нагрузкой подпитать организм быстрыми углеводами. Это даст необходимую энергию.

если такие издевательства будут регулярными, то организм станет делать запасы в виде жира, в общем пузо и третий подбородок обеспечены

Бегаю так 15 лет . потому что вечером другие дела . мышцы как были так и остались . а вот Ахилл болит добегался . Бег только утром интересно голодным ( можно 1 печение и 2 глотка молока )