Из вопроса не понятно, чем затапливает Вашу квартиру - водой из канализации, водопровода, отопления, ливнестоков с крыши.
Предполагая, что это всё-же канализация, и вода при засоре выходит у Вас из унитаза и раковин, могу посоветовать установить на всех подключениях к общей вертикальной трубе ("стояку") - обратные клапана. они сейчас есть в продаже, пластиковые, диаметром как 50 мм, так и 110 мм. Если все соединения будут герметичными, затапливать будет не Вас, а квартиру выше (смешно, но грустно) . С подвалом лучше ничего не делать, иначе его будет затапливать и при исправной трубе, а это - запах, сырость, комары и т. п. Правильный путь - заставить управляющую компанию поменять трубы как в доме, так и на улице - до колодца. Или, как минимум, их промыть.