Платить налог Вы не будете. И то, что свидетельство на 2/3 собственности Вы получили менее 3-х лет назад на необходимость уплачивать налог не влияет.
Дело вот в чем. Квартира. о которой идет речь была в общей долевой собственности Вашей семьи. И произошло это радостное событие (оформление права собственности) в 2008 году, т. е. более трех лет назад. Именно от даты первоначальной регистрации права собственности и отсчитывается срок владения данной квартирой. То, что в 2009 году Ваша доля изменилась, никак не повлияло на основное: как была в общей долевой собственности квартира, так и осталась - изменился только состав собственников.
Таким образом, изменение размера доли в общей долевой собственности не играет роли при определении срока владения такой собственностью. Для Вас этот срок - более 3-х лет. Следовательно, при продаже этой квартиры Ваш доход не облагается налогом. Декларацию также представлять не надо.
На эту тему есть разъяснения Минфина, весьма свежие - например, письмо от 17.02.2012 № 03-04-05/6-189.