Получил от контрагента Договор, с учетом НДС 20% - я ИП на упрощенке

Если готов перейти на ОСН, то вперед, подписывай договор с НДС и разбирайся с ИФНС. Или говори контрагенту, что без НДС работаешь, пусть договор переделает

если покупатель, то вам ваще не стоит волноваться, ндс вы учтете в своих расходах, при условии, что у вас усн 15%
ну, а если, наоборот, вы продавец, то имеете полное право не работать с ним, ибо потом вам придется рассчитывать ндс со своей реализации, платить его в бюджет, более того, подавать декларации

Ну если вам этот Договор важен как подрядчику на ремонтные работы, то в принципе, можно найти решение.
Если вы, допустим, какой-то там мелкий ИПэшник на УСН 6 % с дохода, который хочет заключить договор подряда на ремонтные работы с организацией на ОСНО с НДС, а до этого все ваши подряды были только с частниками или с мелкими фирмочками на УСН и ПСН, ЕНВД, когда вы могли для таких заказчиков сами строй. материалы закупать в розничных магазинах по товарным чекам, навариваться на скидках для вас как постоянного клиента этих магазинов, и на перепродаже этих строй. материалов, включая все это цену договора с вашими строй. материалами "под ключ", а не только на самих работах, то в данном случае такое не прокатит.
В данном случае, с заказчиком на ОСНО с НДС, чтобы заключить договор, вы сможете заработать только на самих ваших услугах, которые будут без НДС и договор будет только на сами работы, без ваших материалов. Перепродавать строй. материалы, включая их в цену всего подряда и покупать их самому в рознице без НДС не получится.
И заказчик на такое согласится, так как при выполнении этих услуг и возмещать НДС не с чего, кроме допустим электроэнергии, воды, которые наверно идут за счет заказчика.
Но в данном случае и все затраты на строй. материалы должны приобретаться самим заказчиком, и с НДС. Поэтому договор подряда должен быть с условием, что подрядные работы производятся только из материалов заказчика. Вот тогда с вами его могут заключить.
Исходя из этого и эти строй. материалы, должны покупаться заранее в нужном количестве и оптовиков с НДС, а не покупаться вами в розничных магазинах и тп.
Чтобы такое обеспечить, вы должны составить подробную калькуляцию к договору -чего и сколько какой марки и тп. Ну также должны вставить условие, что заказчик может еще что-то дополнительно приобрести из мелких строй. материалов по вашей заявке, допустим на сумму в целом еще не более 10-20 % к договору, если чего-то не хватит. Вот тогда по договору процентовку подписываете -чего израсходывали и чего осталось при передачи вам.
Покупать у оптовиков с НДС можете и сами по договору комиссии на закупку со заказчиком или пусть он все сам закупает -как договоритесь. При договоре комиссии на закупку, вы покупаете с НДС у оптовиков на свое ИП, а потом перевыставлЯете этот же счет фактуру комитенту -с ндс. И за это ваше комиссионное вознаграждение -проценты от закупки. И тогда вам нужно как агенту тоже декларацию по НДС сдавать -но это геморр, с копеечным договором лучше чтобы заказчик сам покупал строй. материалы. Так как вы будете лопатить чужой НДС -и сдавать декларацию по НДС только в электронном виде, при этом как комиссионер не платите НДС с покупки у оптовика и передаче его заказчику. Только возьни с документами с НДС много.
Также если заключите договор комиссии на закупку строй. материалов у оптовиков с НДС, то стоит учесть что и перевозить их на объект подряда то же нужно, только с перевозчиком работающим с НДС, а не с каким-то частником. А это тоже геморр.
*
Ну а если против такого договора,, то и дальше работайте только с частниками и мелкотой, и не лезьте к крупным заказчикам работающим с НДС.

Если упрощенец выставляет счет-фактуру, то ему придется уплатить весь ндс в бюджет и сдать декларацию по ндс указав его в 12 разделе декларации. Декларация по НДс сдается только электронно. Если упрощенцу выставляют счет-фактуру, то это нормально, этот ндс учитывается в расходах.

уберите строчку " в том числе НДС" - вопрос решен, если поставщика устраивает - вперед и с песней