Влияет ли сумма при продаже квартиры на размер налога

Налог высчитывается от суммы дохода. Чем выше сумма - тем больше налог

13% от 2 млн меньше чем 13% от 10 млн. Как-то так.

конечно, от нее сумма налога рассчитывается, потому иногда по договору занижают стоимость квартиры

кажется так: если владел хатой более трех лет и это твоя первая продажа, то налог вообще не взимается.
а след. продажи уже идут с налогом

Все очень просто.
Если квартира в собственности более 5 лет, то цена не влияет на налогообложение, ибо доходы от продажи такой квартиры освобождены от налогообложения.
Если квартира в собственности более трех лет (это единственное жилье или полученная в наследство или в дар от близкого родственника или в результате приватизации или по договору пожизненного содержания с иждивением), то цена не влияет на налогообложение, ибо доходы от продажи такой квартиры освобождены от налогообложения.
Если квартира в собственности менее трех лет и вы продали квартиру по цене ниже 70% от ее кадастровой стоимости, то цена, указанная вами в договоре купли-продажи квартиры, никак не повлияет на налогообложение, поскольку для целей налогов ваш доход будет рассчитываться как те самые 70% от кадастровой стоимости.
И только в том случае, если до истечения трехлетнего срока владения квартирой цена ее продажи квартиры выше 70% ее кадастровой стоимости, то такая цена напрямую влияет на доход от продажи квартиры, а следовательно и на налогообложение.