Уважаемые юристы, прошу Вас ответить, что делать в такой ситуации! (касается жилья)

Ситуация сложная и очень неприятная. Бабушка должна пойти к нотариусу и подать заявление о принятии наследства по завещанию. Думаю, что она это уже сделала. Потом к нотариусу, если ума хватит, обратится внук наследодателя. Внук наследодателя наследует по праву представления. Хорошо бы было узнать у бабушки, сколько было детей у наследодателя.
Если внук начнет исковое преследование Вашей бабушки, то ей придется доказывать то, что её гражданский муж (наследодатель) был в здравом уме и доброй памяти когда составлял завещание. Внук может обратиться в суд с заявлением о признании завещания недействительным, также может обратиться в суд с требованием о выделении обязательной доли в наследстве (только в случае, если внук был постоянно на иждивении деда и сам был нетрудоспособен, из вопроса этого не усматривается, но и это возможно) .
Что касается угроз, то бабушке также нужны будут свидетели. Одной жить в наследственной квартире для нее будет очень опасно. Поэтому, лучше чтобы бабушка жила ни одна в квартире. Все угрозы, если таковые возникнут, должны быть удостоверены (подтверждены свидетельскими показаниями лиц не состоящих в родстве с бабушкой--лучший вариант) , если в отношении бабушки начнут совершать какие-то противоправные деяния, то с заявлением в милицию, написать, что эти угрозы бабушка рассматривает как реальную угрозу своей жизни и безопасности.
После драки кулаками не машут. Но лучше бы было еще при жизни наследодателя объявить в судебном порядке внука недостойным наследником (достаточно было доказать факт его уклонения от содержания и помощи наследодателю) . Теперь адвокаты едва ли смогут помочь (могут предложить признать его недостойным наследником, но это будет пустая трата денег) . Но если он (внук) , к примеру, один или два раза изобьет бабушку, то это может служить основанием к признанию его недостойным наследником.
По совести-да по совести. Совесть у всех разная. Так что пусть бабушка не берет в голову и делает то, что ей наследодатель велел завещанием!

Пусть подают в суд. Вам это ничем не навредит. После оформления наследства, эти комнаты можно продать и таким образом купить с придачей что-то большее. Или продать все и купить большее. Не судитесь сами, вы ничего не выиграете. Это было желание деда. Большее он и так оставил сожительнице.

Я так думаю,решать бабушке,а не вам слава Богу ...А у неё ,наверное.есть понимание,мудрость и совесть...

Вы бы лучше с завещанием разобрались. В завещание должно быть прописано, если две комнаты, то два документа собственности на эти комнаты, т. е выделенные в натуре. Наверняка не так. Либо написано 2/3 бабушке-сожительнице и 1/3 внуку. Иначе говоря долевая собственность. В отношении остального должно быть как предписывает закон. "Отбивать" ничего не следует.

Когда бабушка вступит в права наследования, она имеет право продать принадлежащюю ей часть квартиры и таким ображом избавиться от не желательного соседства

Бабушка также имеет преимущественное право выкупить долю внука (если он продаст) . Или обоим продать всю квартиру и разойтись.
Доля - это не конкретная комната, это доля в праве. И каждый сособственник может жить по всей квартире, если не договорятся иначе.

Если не выкупит, могут продать цыганам или таджикам - бабушка сама сбежит.

и лучше купить бабушке рядом с вами, но не вместе.