можно ли заключить договор о материальной ответственности с работником, если он работает по договору подряда

Елена, нельзя называть человека, работающего по договору подряда, работником! Если такое слово в договоре подряда напишете, этот договор суд сможет признать трудовым.
Договор материальной ответственности можно заключить только с работником, но не с подрядчиком.

Если договор подряда еще не заключен, то пропишите в нем ответственность сторон за инструменты и материалы, можно даже акт приема-передачи имущества составить, чтобы потом при приемке испорченного оборудования было, на что опираться.

Если договор подряда уже подписан, в него можно внести изменения и дополнения (письменно) при условии, что вторая сторона согласна.

эти условия вносятся в договор подряда (кто и за что отвечает. за что - подрядчик, за что - заказчик) - ст. 705 ГК РФ

просто в договоре указывается в каком состоянии обязан подрядчик вернуть то, что следует вернуть и передается все подрядчику по акту приемки-передачи.. .

фктически без документального оформления пользования вашим имуществом подрядчиком - он не несет никакой ответственности, кроме той, что требуется доказать...

1.4. Подрядчик несет ответственность за вверенное ему имущество и за любое действие, повлекшее за собой утрату или порчу имущества.
1.5. Подрядчик, выполняющий работу из своего материала, несет ответственность в случае недоброкачественности материала.
1.6. Риск случайной гибели или случайной порчи материала несет сторона, предоставившая материал.

2. Условия выполнения работы

2.1. Если в процессе выполнения работы Подрядчик допустил отступления от условий договора, ухудшившие качество работы, то по требованию Заказчика он обязан безвозмездно исправить все выявленные недостатки в установленный по согласованию сторон срок. Отказ от исправления выявленных недостатков влечет для Подрядчика штрафные санкции. Заказчику предоставляется в этом случае право поручить исправление недостатков третьим лицам (организациям) за счет Подрядчика.
2.2. При наличии существенных недостатков на одном из этапов работы, приводящих к невозможности выполнения всей работы в соответствии с требованиями технической или иной документации, представленной Заказчиком, Заказчик расторгает договор без оплаты выполненной Подрядчиком работ.
2.3. О выполнении отдельных этапов работ Подрядчик предоставляет Заказчику отчеты в согласованные сторонами сроки, а также промежуточные результаты работы для контроля за соблюдением сроков и качества выполненных работ.
2.4. Подрядчик самостоятельно организует всю работу по исполнению настоящего договора, определяет непосредственных исполнителей и распределяет обязанности между ними.

Да, но ето все должно прописано в етом договоре.

ст. 705 и 714 ГК РФ