Что значит уволить по несоответствию занимаемой должности ?(в чем должно быть это несоответствие?)

Трудовой кодекс Российской Федерации предусматривает в качестве основания прекращения трудового договора по инициативе работодателя несоответствие работника занимаемой должности или выполняемой работе вследствие недостаточной квалификации, подтвержденной результатами аттестации (п. 3 ч. 1 ст. 81 ТК РФ) .
Порядок проведения аттестации устанавливается трудовым законодательством и иными нормативными правовыми актами, содержащими нормы трудового права, локальными нормативными актами, принимаемыми с учетом мнения представительного органа работников.
Таким образом, Трудовым кодексом увольнение работника по указанному основанию без проведения аттестации не предусмотрено.

несоответствие по образованию, например. Либо его недостаточно, либо не тот профиль. Несдача квалификационного экзамена.
В других случаях доказать несоответствие сложно

Если у работника имеются систематические взыскания за ненадлежащее исполнение своих обязанностей - это и есть основание для увольнения по несоответствию

У каждого рабочего места (должности) должна быть инструкция, которая утверждается руководителем, либо для каждого сотрудника (должности) составляется регламент. Этот документ должен содержать: требования к работнику (например, по образованию, стажу, обязательному знанию нормативных документов) , перечень обязанностей (работ, которые сотрудник должен выполнять) , показателей, которыми работа может оцениваться. Каждый сотрудник должен быть под подпись ознакомлен с таким регламентом.
Имея регламент или инструкцию можно точно установить, что именно должен выполнять работник. Соответственно, легче подтвердить, что он не делал. Каждый факт неисполнения или ненадлежащего исполнения обязанностей должен быть подтвержден, например, докладной запиской его начальника.
Далее обязательно должна быть официально и правильно проведена аттестация этого работника (с отрицательными выводами, естественно) .
Регламент (инструкция, договор) с четко установленными обязанностями и требованиями + докладные записки об их не исполнении или нарушениях в исполнении + иные документы, подтверждающие нарушения (например, приказы о служебных проверках и их результатах) + результаты аттестации = увольнение по несоответствию должности.
Дело муторное и легко оспариваемое в судах

оч пространная формулировка, однако, если не проводилась аттестация, то такую формулировку приминять не стоит.