Работаю в ИП с 1 марта 2009, а 1 сент 2009 (ровно через полгода) ушла в отпуск по беременности и родам. Вопрос внутри.

Если речь идет об очередном отпуске, то Вам положен отпуск за период 01.03.2009 по день оформления отпуска по уходу за ребенком 18.01.2010-28кал. дней.
Его Вы можете взять сразу после окончания отпуска по уходу за ребенком до 1,5 лет.

Комментарий к статье 260

Комментируемая статья закрепляет право женщины на получение ежегодного оплачиваемого отпуска независимо от стажа работы перед отпуском по беременности и родам, либо непосредственно после него, либо по окончании отпуска по уходу за ребенком.
Предоставление ежегодного оплачиваемого отпуска в данном случае осуществляется работодателем лишь по заявлению женщины. При отсутствии такого заявления работодатель не вправе приурочивать ежегодный отпуск женщины к ее отпуску по беременности и родам или отпуску по уходу за ребенком.
Даже при отсутствии 6-месячного непрерывного стажа работы ежегодный отпуск беременной женщине и женщине, родившей ребенка, должен быть предоставлен в полном размере, а не пропорционально проработанному времени. В этом случае отпуск предоставляется авансом за первый год работы, в счет которого включается также отпуск по беременности и родам (ст. 122 ТК).

где вопрос?

6. В случае если работник не имел фактически начисленной заработной платы или фактически отработанных дней за расчетный период или за период, превышающий расчетный период, либо этот период состоял из времени, исключаемого из расчетного периода в соответствии с пунктом 5 настоящего Положения, средний заработок определяется исходя из суммы заработной платы, фактически начисленной за предшествующий период, равный расчетному.