По результатам ревизии, если есть недостача, какую стоимость удерживают с сотрудников? (закупочную или уже с наценкой?)

В ст. 238 ТК РФ, где говорится о том, что неполученный доход (упущенная выгода) не подлежит взысканию с работника.
А, исходя из ст. 246 ТК РФ, ущерб с работника может быть взыскан по балансовой стоимости испорченного имущества или по рыночной цене, если она не ниже его балансовой стоимости.
Для установления размера ущерба, подлежащего возмещению виновным лицом, организации необходимо сравнить две суммы:
- стоимость недостающих ценностей по данным бухгалтерского учета, т. е. их балансовую или остаточную стоимость, если речь идет об основных средствах или нематериальных активах;
- стоимость недостающих ценностей исходя из сложившихся рыночных цен на дату проведения инвентаризации и обнаружения данной недостачи.
Ущерб определяется по рыночным ценам, действующим в данной местности на день причинения ущерба. . Под "данной местностью" следует иметь в виду населенный пункт в пределах существующего административно-территориального образования.
Если "бухгалтерская" стоимость имущества оказалась выше рыночной, размер ущерба следует определить исходя из "бухгалтерской" стоимости. Если же рыночная стоимость имущества превышает "бухгалтерскую", взыскание будет осуществляться исходя из рыночной стоимости. В соответствии со ст. 247 ТК РФ работодатель обязан провести проверку для установления размера причиненного ущерба и причин его возникновения.
Трудовое законодательство не содержит положений, устанавливающих порядок определения рыночной цены. В данном случае возможно привлечение независимого оценщика или эксперта, который определил бы стоимость имущества в соответствии с Федеральным законом от 29 июля 1998 г. N 135-ФЗ "Об оценочной деятельности в Российской Федерации".
Уровень рыночных цен подтверждается документами, собранными работодателем для проверки. Ведь работник вполне может обжаловать размер вменяемого ему ущерба, и тогда доказывать свою правоту должен будет именно работодатель

Стоимость недостающих ценностей по данным бухгалтерского учета - лишь нижняя граница суммы ущерба, подлежащей взысканию.

И если организация не хочет принимать на себя бремя доказывания обоснованности рыночной цены (в случае возникновения судебного спора с работником), то вероятнее всего будет взыскивать с работника только фактическую себестоимость.

Закупочная.
Взыщут и без договора о полной мат. ответственности.

Инвентаризационную, т. е. закупочную. И существует очень много ограничений по поводу удержаний из з/пл. Статьи искать на ночь вряд ли кто-то будет, почитайте Трудовой кодекс.

Согласно ст. 241 ТК РФ
За причинённый ущерб работник несёт материальную ответственность в ПРЕДЕЛАХ среднего МЕСЯЧНОГО ЗАРАБОТКА, если иное не предусмотрено ТК РФ или иными федеральными законами !!!

Согласно ст. 244 ТК РФ
Письменные договора о ПОЛНОЙ индивидуальной или коллективной (бригадной) материальной ответственности, т. е. о возмещении работодателю причинённого ущерба в полном размере за недостачу вверенного работникам имущества, могут заключаться с работниками, достигшими возраста 18-ти лет и непосредственно обслуживающими или использующими денежные, товарные ценности или иное имущество !!!

Тем самым, исходя из выше изложенного имеются законные основания утверждать что:
- если с вами НЕ был подписан Договор о ПОЛНОЙ материальной ответственности то в этом случае, за причинённый ущерб вы как работник несёте материальную ответственность в ПРЕДЕЛАХ среднего МЕСЯЧНОГО ЗАРАБОТКА !!!