я была на сессии, мне оплатили её,как обычный отпуск.

Совершенно не прав.
Учебный отпуск - совершенно самостоятельный вид отпусков, предоставляется получающим первое высшее образование. Причем предоставляется обязательно, независимо от того, хочется это работодателю или нет, получаете Вы "подходящую" специальность или абсолютно с работой не связанную. Если учебное заведение имеет государственную аккредитацию и высшее образование, которое Вы получаете, первое - работодатель обязан предоставить учебный отпуск и оплатить его. Вам только необходимо представить справку-вызов и подтверждение того, что Вы были именно на сессии (та же справка - продолжение) .
Предоставление учебного отпуска не отменяет отпуск обычный, ежегодный. И не сокращает его. И тем более не означает, что ежегодный отпуск не надо оплачивать или удерживать из него оплату за учебный.
Это ДВА РАЗНЫХ ОТПУСКА, ничем не связанных (как говорится: мухи отдельно, котлеты отдельно) .
Проблемы бухгалтера с проведением отпуска в программе Вас абсолютно не касаются Это не повод нарушать трудовой кодекс.

нет не прав

Вы же расписывались в приказе. Надо поднять приказ. Может быть Вы подписались автоматически и не обратили внимание на текст приказа. Может быть не предоставили справку -вызов, может нет аккредитации и лицензии у ВУЗа. Здесь надо разбираться. А в программе 1С разделение на отпуска ( учебные, без сохранения, очередной отпуск ) есть. Так что, если все документы предоставлены во время, значит бухгалтер не прав.

Возьмите расчетный лист в бухгалтерии и напишите жалобу в трудовую инспекцию своего региона. Они научат вашего бухгалтера правильно считать. Все решится в течении месяца. Можно жалобу и по интернету написать. Адрес найдете на сайте Роструд.

Учебный отпуск работодатель обязан предоставить работнику, если он впервые получает образование. Этот отпуск имеет целевое назначение и никакого отношения к очередному не имеет. Ваш главный бухгалтер решила сэкономить. Со стороны главного бухгалтера нарушение трудового законодательства.

учебный отпуск-целевой и к очередному никакого отношения к очередному не имеет. Внимательнр изучите трудовой кодекс. Ваши расчётчики не правы

ученический отпуск не как не связан с очередным, и он не имеет право потом удерживать. У меня на предприятие ученический оплачивается отдельно (по среднему)