Я получаю доплату как молодой специалист в размере 50% от оклада, сохраняетсяли доплата н время боьничного?

если Вы болели, то только за б/л оплата. А вот для начисления за б/л для среднедневной конечно войдет доплата.

Больничный лист оплачивается исходя из среднего заработка работника за счет средств ФСС РФ (при условии, что страховой стаж более 6 мес. - если менее, то пособие назначается исходя из минимального размера оплаты труда. Работодатель при этом может производить доплату за счет собственных средств до среднего заработка, если это предусмотрено локальным нормативным актом, например, положением об оплате труда или коллективным договором)
В средний заработок включаются все выплаты, установленные действующей в организации системой оплаты труда и с которых уплачиваются обязательные страховые взносы, в том числе доплаты молодым специалистам.

Статья 183 ТК РФ . Гарантии работнику при временной нетрудоспособности

При временной нетрудоспособности работодатель выплачивает работнику пособие по временной нетрудоспособности в соответствии с федеральными законами.
Размеры пособий по временной нетрудоспособности и условия их выплаты устанавливаются федеральными законами.
ФЕДЕРАЛЬНЫЙ ЗАКОН от 25.11.2008 N 216-ФЗ "О БЮДЖЕТЕ ФОНДА СОЦИАЛЬНОГО СТРАХОВАНИЯ РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ НА 2009 ГОД И НА ПЛАНОВЫЙ ПЕРИОД 2010 И 2011 ГОДОВ"
Статья 8. Особенности установления отдельных расходных обязательств бюджета Фонда
1. Установить, что в 2009 году:
1) максимальный размер пособия по временной нетрудоспособности (за исключением пособия по временной нетрудоспособности в связи с несчастным случаем на производстве или профессиональным заболеванием) за полный календарный месяц не может превышать в 2009 году 18 720 рублей. <*> В районах и местностях, в которых в установленном порядке применяются районные коэффициенты к заработной плате, размер пособия определяется с учетом этих районных коэффициентов.