"И почил в день седьмый от всех дел Своих" (Быт., 2:2). Зачем богу отдыхать, если он всемогущ (Иов., 42:2)?

Бог стал покоиться в том смысле, что он просто прекратил творить в физической сфере Земли

Ин 5:17: «...Мой Отец до сих пор трудится, и я тружусь»...»

В том то и дело, что всемогущ, потому может и поспать даже.

Как же понять этот «покой» Божий, когда сам Господь наш Иисус Христос сказал: «Отец Мой доныне делает, и Я делаю» (Ин 5.17)?

Ответ на это имеется в самом рассматриваемом нами тексте, где ясно указано то дело, от которого Бог почил в седьмой день: это, именно, Его творчески-образовательная деятельность шести предшествующих дней; «Бог почил от всего дела, которое Он делал» и речь о котором только что шла все время перед этим, - «перестал творить вещи, подобные только что сотворенным», как поясняет текст Библии арабский перефраз ее. «Бог почил, - говорит блаженный Августин, - от создания новых видов твари, потому что Он уже не творил больше какого-либо нового рода ее». «Почил, - говорит святой Иоанн Златоуст, - значит перестал творить и производить из небытия в бытие». Но, прекратив творчество, Бог никогда не оставлял Своей промыслительной деятельности по отношению к миру и человеку (Пс 103.28; Еккл 12.7; Ис 57.16; Иер 38.16; Неем 9.6; Ин 5.16,17; Евр 4.9-10.

от вершения суда над людьми, 1000 лет благоденствия ещё не наступило

Иегова никогда не перестает трудиться (Иоанна 5:17). Иегова стал покоиться в том смысле, что он просто прекратил творить в физической сфере Земли. Но он продолжает трудиться, приводя в исполнение свои намерения. Результатом этого труда явилось написание вдохновленного им Слова, Библии.

Это значит, что процесс творения завершился. Но у него есть много других дел, которые Он всегда совершал, совершает и еще будет совершать. Однажды процесс сотворения возобновится:
"И сказал Сидящий на престоле: се, творю все новое. И говорит мне: напиши; ибо слова сии истинны и верны."
(RST Откровение 21:5)
"Разве ты не знаешь? разве ты не слышал, что вечный Господь Бог, сотворивший концы земли, не утомляется и не изнемогает? разум Его неисследим."
(RST Исаия 40:28)

Он закончил создавать материальное.

17. это — знамение между Мною и сынами Израилевыми на веки, потому что в шесть дней сотворил Господь небо и землю, а в день седьмой почил и покоился.
(Книга Исход 31:17)

Если Бог закончил творить, то это не значит, что Он бездельничает.

17. Иисус же говорил им: Отец Мой доныне делает, и Я делаю.
(Св. Евангелие от Иоанна 5:17)