Почему у самолетов руль направления управляется педалями, а не штурвалом?

Нет никаких трудностей, можешь построить самолет по твоим представлениям, и научиться им управлять. Никаких проблем! А существующие самолеты никто переделывать не станет, ибо бесполезная возня. Зачем ломать то, что уже работает, и переучивать людей, которые уже умеют?
Могу тебе сходу назвать одну причину, почему киль не управляется со штурвала. Потому что любое отклонение этой плоскости от центрального положения - НЕНОРМАЛЬНО. Киль для того и нужен, чтобы удерживать ось самолета вдоль его траектории. Он работает как флюгер, или как хвост воздушного змея. И вмешиваться в это равновесие - только вредить. Рулем направления пользуются лишь кратковременно, когда надо приземлиться при боковом ветре - чтобы не коснуться земли "боком" и шасси не заскользило юзом. Но лететь ДОЛГО с отклоненным рулем направления - незачем. Это и аэродинамику самолета портит. Ну а зачем выводить на такой оперативный и доступный орган управления как штурвал - такую редко и мало используемую функцию? Неразумно!
Тем более, что руль направления вообще почти все время управляется автоматикой.

как исторически сложилось - так и управляют. А сложилось так потому, что руль двигали тросиками, а это требует неслабую силу.

Поначалу были разные схемы, в итоге сложилась самая УДОБНАЯ, а не ЛОГИЧНАЯ... впрочем, она потому и удобная, что логичная: рулем в авиации пользуются меньше всего, а главное, для этого не нужно большой ТОЧНОСТИ движений, поэтому самое малозначимое доверили ногам, а все важное - рукам... логично.
https://www.youtube.com/watch?v=tdPIQvPSczk

В принципе этот руль не нужен
Я управляя радиомоделью никогда не пользуюсь рулем направления.. обхожусь виражами для поворотов

У пилота и так спина мокрая при посадке, ему приходиться удерживать штурвал в двух плоскостях, а вы предлагаете ему еще третью добавить. Может пилоты еще и напитки будут разносить во время полета?

Мне кажется что логичнее было бы делать так:
Тангаж - наклон вперед/назад.
Крен - наклон влево/вправо.
Рыскание - поворот влево/вправо.

Ииии в чем суть изменений? Так оно и есть...
Но самолет — не автомобиль, и одним рысканьем сыт не будешь. Он же в трех осях поворачивает.

Для этого что-то вроде шоферской "баранки" на штурвале потребуется. Кстати, один самодельщик именно так и сделал.
Отклонять штурвал и одновременно поворачивать "руль" неудобно, поскольку одна рука на РУДах. Про штурвальные колонки на тяжёлых самолётах, и говорить нечего.

Потомучто рулём толком никто не рулит. Это не эффективно.

Че? На педали, насколько помню, элероны выведены. На штурвал - рулевая плоскость.
Технических трудностей нет. Есть необходимость разделить управление рулем и элеронами.

Ноги сильнее

А теперь попробуй всю эту проводку управления запихнуть в штурвальную колонку. Ты в курсе, что существует жёсткая (тяги) и тросовая проводка управления? А ещё ты в курсе, что есть резервная система управления и дублирующая. И как это всё скомпоновать в трубе диаметром, чуть более 100 мм, хрен его знает правда? Это я тебе ещё про качалки управления, ролики тросовой проводки, гермопереходы, компенсаторы, натяжные устройства и т. д. не написал.
Да и не забывай, что педалями управляют так же рулевым колесом и тормозами основных колёс, а так же раздельным подтормаживанием при малых углах разворота самолёта.

поворот в воздухе происходит путём наклона с помощью элеронов, а руль на киле только для земной рулёжки, но все они связаны одной тягой из эргомичных соображений

Педали нужны для удержания направления при разбеге\пробеге, для устранения скольжения в полете и для создания скольжения при необходимости "притормозить". Разворот выполняется так: создаешь крен штурвалом и тянешь его на себя. В случае смещения шарика давишь на педаль в которую сторону он сместился. Он не обязательно будет смешаться, особенно у одномоторных самолетов с пропеллером.