Я выставляю сч/ф на аванс.Затем через пол мес отгрузка.Каким числом мне делать сторнирующ .запись в книге покупок?

При получении аванса выставляете сч-ф. Д76.А К68.2 с записью в книгу продаж. В ДЕНЬ ОТГРУЗКИ выставляете сч. -ф. на отгрузку: Д90 К68.2 с записью в книгу продаж. Одновременно В ДЕНЬ ОТГРУЗКИ делаете запись в книгу покупок на сумму НДС с аванса: Д68.2 К76.А
Никаких "сторно" при этом не делается.

так авансовая счет-фактура от поставщика или ваша авансовая счет-фактура для клиента?
Если вам пришел аванс - вы выставляете счет-фактуру на сумму аванса. Потом происходит отгрузка и счет-фактура на отгрузку. Одновременно - сторно авансовой счет-фактуры в книге покупок.

Согласна со Светланой. Никаких сторно!!! !
Если вам аванс - книга продаж, на дату отргузки по этому авансу - книга покупок.
Если мы авнс - книга покупок (при наличиис/ф и прописанного аванса в договоре) , на дату принятия товаров, работ, услуг на учет - книга продаж.

когда выставляете сч/ф на аванс регистрируйте её в книге продаж и делаете проводку Д-76. АВ К-68.2.
когда происходит отгрузка и зачет аванса вы выписываете сч/ф на отгрузку с проводками Д-90.3 К-68.2.
одновременно сторнируете авансовый сч/ф Д-68.2 К-76. АВ и отражаете в книге покупок.

Проводки можно посмотреть здесь http://www.glavbuh.net/bn_ychet/vychet-nds-s-uplachennyh-avansov/ Если Вы работаете в программе 1С, то она всё сделает сама при формировании книги покупок и продаж. И совсем не понятен вопрос - Вы поставщик или покупатель?.