Have you ever see the rain. Почему тут have? Ведь тут нет модального глагола. Тут разве не перфектный инфинитив?

Have you ever SEEN the rain? --Ты когда-нибудь видел дождь.
Have здесь вспомогательный глагол. Видо-временная форма - Present Perfect, которая образуется have (has - he, she, it) + Причастие 2 (3 форма для неправильных глаголов или окончание ED для правильных глаголов) .
Не путайте инфинитивы и видо-временные формы.
Перфектный инфинитив используется в сочетании с модальными глаголами (и не только с ними) для показания отнесённости к прошлому.
She sould have seen the play. - Ей следовало бы посмотреть эту пьесу.
Present Perfect же это видо-временная форма, то есть настоящее совершённое время, которое показывает связь с настоящим. Present Perfect же показывает СВЯЗЬ с настоящим. Всегда.
Это либо опыт к настоящему моменту.
I have never been to parties. I have been to many parties.
Либо период не прошлый, а НАСТОЯЩИЙ, то есть период ещё длится. (неистёкший к настоящему моменту)
I have been to a party this week.
Либо результат в НАСТОЯЩЕМ, как например, She has broken a leg. - Она сломала ногу. То есть акцент на том, что СЕЙЧАС у неё сломана нога.
Именно поэтому это время и есть PRESENT - настоящее. Неважно время его совершения, важен сам факт, результат, связь с настоящим.

не инфинитив, а 3-я форма глагола. А у вас почему-то инфинитив.

Все очень просто. Предложение не указывает конкретно когда это действие произошло в прошлом. То есть видел ли когда-нибудь, был ли где-нибудь. Оттого и форма have been, have seen глаголы в третьем лице. Если было бы указано конкретно вчера там или в прошлом году. Тогда было бы was, were, did.

поомучто не see, a seen

по правилам have должно быть.. Present Perfect все таки. Только правильно должно быть так: Have you ever seen, have+3 форма глагола

I wanna know, have you ever seen the rain
Comin' down on a sunny day?
(Creedence Clearwater Revival)